Ιδρύθηκε το 1969 από την Ένωση Μηλίων της Αθήνας. Στεγάζεται σε ένα χαρακτηριστικό σπίτι της Μήλου σε προνομιακή θέση στην Πλάκα το οποίο αγοράστηκε από την οικογένεια Φιλλίπου Οικονόμου με σκοπό να παρουσιάσει το αστικό νοικοκυριό του 19ου αιώνα μέσα από την οργάνωση των χώρων ενός σπιτιού, η ανάλογη επίπλωση και διακόσμηση καθρέφτιζε την οικονομική αλλά και κοινωνική θέση της οικογένειας, τις ιδιαιτερότητες της καθημερινής ζωής της Μήλου την περίοδο μετά την επανάσταση του 1821 μέχρι τον μεσοπόλεμο. Στο λαογραφικό μουσείο της Μήλου υπάρχουν εκθέματα από αρχοντικά, αστικά και αγροτικά σπίτια.  Τα αντικείμενα - από αρχοντικά, αστικά και αγροτικά νοικοκυριά - εκτίθενται στα δωμάτια του σπιτιού ανάλογα με τη χρήση τους τα οποία πλαισιώνονται από συνοπτικά κείμενα και εποπτικό υλικό.